Stefan Becker, M.Sc.

Institut für Medizintechnik

Universität zu Lübeck
Ratzeburger Allee 160
23562 Lübeck
Gebäude 64, Raum 052

Email:becker(at)imt.uni-luebeck.de
Phone:+49 451 3101 5445
Fax:+49 451 3101 5404

Role

Research Assistant


Research

Involved Projects

  • In-Silico Brain Tumor Growth
  • Non-Rigid Image Registration in Neuroimaging

Curriculum Vitae

STEFAN BECKER was born in Wismar, Germany in 1983. He received his M.Sc. in Computer Science in 2009 from the University of Lübeck, Germany. In 2008/2009, he wrote his master thesis at the Institute of Medical Engineering, University of Lübeck, about the approximation of brain deformation resulting from tumor progression. He is a research assistant at the Institute of Medical Engineering since 04/2009. There he continues his work in the field of in-silico brain tumor growth.


Publications

[ 2013 ] [ 2012 ] [ 2011 ] [ 2010 ] [ 2009 ]

2013 [ to top ]

  • Mang, A., Stritzel, J., Toma, A., Becker, S., Schuetz, T. A. and Buzug, T. M.: Personalisierte Modellierung der Progression primärer Hirntumoren als Optimierungsproblem mit Differentialgleichungsnebenbedingung, In: Bildverarbeitung für die Medizin, 57-62, 2013, DOI: 10.1007/978-3-642-36480-8_12.
     
  • Toma, A., Castillo, L. R. C., Schuetz, T. A., Becker, S., Mang, A., Regnier-Vigouroux, A. and Buzug, T. M.: A Validated Mathematical Model of Tumour-Immune Interactions for Glioblastoma, Current Medical Imaging Reviews, 9(2), 145-153, 2013, DOI: 10.2174/1573405611309020010.
     
  • Schuetz, T. A., Becker, S., Mang, A., Toma, A. and Buzug, T. M.: Modelling of glioblastoma growth by linking a molecular interaction network with an agent-based model, Mathematical and Computer Modelling of Dynamical Systems, 19(5), 417-433, 2013, DOI: 10.1080/13873954.2013.777748.
     

2012 [ to top ]

  • Becker, S., Popp, K., Mang, A., Schuetz, T. A., Toma, A., Dunst, J., Rades, D. and Buzug, T. M.: A Mathematical Model to Simulate the Progression and Treatment of Brain Metastasis, In: Annual Meeting and Conference of the Society for Mathematical Biology, 31, 2012.
     
  • Toma, A., Régnier-Vigouroux, A., Mang, A., Schütz, T. A., Becker, S. and Buzug, T. M.: In-silico Modellierung der Immunantwort auf Hirntumorwachstum, In: Bildverarbeitung für die Medizin, 123-128, 2012, DOI: 10.1007/978-3-642-28502-8_23.
     
  • Mang, A., Toma, A., Schuetz, T. A., Becker, S., Eckey, T., Mohr, C., Petersen, D. and Buzug, T. M.: Biophysical modeling of brain tumor progression: From unconditionally stable explicit time integration to an inverse problem with parabolic PDE constraints for model calibration, Medical Physics, 39(7), 4444-4459, 2012, DOI: 10.1118/1.4722749.
     
  • Schuetz, T. A., Moeller, S., Becker, S., Mang, A. and Toma, A.: A Cross-scale Model of Tumor Growth: Do We Need to Model Molecular Interactions in Separate Artificial Compartments within a Cell?, In: International Conference on Mathematical Modelling, 1294-1299, 2012.
     
  • Toma, A., Mang, A., Becker, S., Schuetz, T. A. and Buzug, T. M.: Can Mathematical Modelling help to cure Glioblastoma Multiforme?, In: Journal of Cancer Research and Clinical Oncology, 391, 2012.
     
  • Mang, A., Toma, A., Schütz, T. A., Becker, S. and Buzug, T. M.: Eine effiziente Parallel-Implementierung eines stabilen Euler-Cauchy-Verfahrens für die Modellierung von Tumorwachstum, In: Bildverarbeitung für die Medizin, 63-68, 2012, DOI: 10.1007/978-3-642-28502-8_13.
     
  • Mang, A., Schutz, T. A., Toma, A., Becker, S. and Buzug, T. M.: An efficient, variational non-parametric model of tumour induced brain deformation to aid non-diffeomorphic image registration, In: Biomedical Imaging: From Nano to Macro, 732-735, 2012, DOI: 10.1109/ISBI.2012.6235652.
     
  • Mang, A., Schütz, T. A., Toma, A., Becker, S. and Buzug, T. M.: Ein dämonenartiger Ansatz zur Modellierung tumorinduzierter Gewebedeformation als Prior für die nicht-rigide Bildregistrierung, In: Bildverarbeitung für die Medizin, 422-427, 2012, DOI: 10.1007/978-3-642-28502-8_73.
     
  • Toma, A., Holl-Ulrich, K., Becker, S., Mang, A., Schuetz, T. A. and Buzug, T. M.: Mathematical Modeling of Tumor Dynamics and Radiotherapy for Early Glioma, In: Annual Meeting and Conference of the Society for Mathematical Biology, PS8, 2012.
     
  • Mang, A., Schuetz, T. A., Becker, S., Toma, A. and Buzug, T. M.: Cyclic Numerical Time Integration in Variational Non-Rigid Image Registration based on Quadratic Regularisation, Vision, Modeling and Visualization, 143-150, 2012, DOI: 10.2312/PE/VMV/VMV12/143-150.
     
  • Becker, S., Mang, A., Toma, A., Schütz, T. A. and Buzug, T. M.: Modelling the Progression of Brain Metastases, In: Deutsche Gesellschaft für Biomedizinische Technik Jahrestagung, 812, 2012, DOI: 10.1515/bmt-2012-4290.
     
  • Toma, A., Mang, A., Schuetz, T. A., Becker, S. and Buzug, T. M.: A Novel Method for Simulating the Extracellular Matrix in Models of Tumour Growth, Computational and Mathematical Methods in Medicine, 2012, 109019, 2012, DOI: 10.1155/2012/109019.
     
  • Schuetz, T. A., Becker, S., Mang, A., Toma, A. and Buzug, T. M.: A computational multiscale model of glioblastoma growth: Regulation of cell migration and proliferation via microRNA-451, LKB1 and AMPK, In: Engineering in Medicine and Biology Society, 6620-6623, 2012, DOI: 10.1109/EMBC.2012.6347512.
     
  • Toma, A., Holl-Ulrich, K., Becker, S., Mang, A., Schütz, T. A., Bonsanto, M. M., Tronnier, V. and Buzug, T. M.: A Mathematical Model to Simulate Glioma Growth and Radiotherapy at the Microscopic Level, In: Deutsche Gesellschaft für Biomedizinische Technik Jahrestagung, 218-221, 2012, DOI: 10.1515/bmt-2012-4081.
     
  • Mang, A., Toma, A., Becker, S., Schuetz, T. A. and Buzug, T. M.: Fast Explicit Variational Diffusion Registration, In: Deutsche Gesellschaft für Biomedizinische Technik Jahrestagung, 46, 2012, DOI: 10.1515/bmt-2012-4235.
     
  • Mang, A., Toma, A., Schuetz, T. A., Becker, S. and Buzug, T. M.: A Generic Framework for Modeling Brain Deformation as a Constrained Parametric Optimization Problem to Aid Non-diffeomorphic Image Registration in Brain Tumor Imaging, Methods of Information in Medicine, 51(5), 429-440, 2012, DOI: 10.3414/me11-02-0036.
     
  • Becker, S., Popp, K., Mang, A., Schuetz, T. A., Toma, A., Dunst, J., Buzug, T. M. and Rades, D.: A New Mathematical Model to Simulate the Progression of Brain Metastasis, 297-298, 2012, DOI: 10.1016/j.ijrobp.2012.07.777.
     
  • Toma, A., Régnier-Vigouroux, A., Mang, A., Becker, S., Schuetz, T. A. and Buzug, T. M.: In-silico modelling of tumour-immune system interactions for glioblastomas, In: International Conference on Mathematical Modelling, 2012, DOI: 10.3182/20120215-3-at-3016.00219.
     

2011 [ to top ]

  • Heye, A., Becker, S., Mang, A., Schuetz, T. A., Toma, A. and Buzug, T. M.: A continuous model of tumour progression and radiotherapy, In: Biomedizinische Technik / Biomedical Engineering, 2011, DOI: 10.1515/BMT.2011.836.
     
  • Mang, A., Toma, A., Becker, S., Schuetz, T. A. and Buzug, T. M.: Modellierung von Tumorwachstum: Über stabile explizite und implizite numerische Verfahren zur Lösung eines Anfangsrandwertproblems, In: Proceedings Medizinische Physik, 88-89, 2011.
     
  • Heye, A., Becker, S., Mang, A., Schütz, T. A., Toma, A. and Buzug, T. M.: Ein kontinuierlicher Ansatz zur Modellierung von Tumorwachstum und Strahlentherapie, In: Bildverarbeitung für die Medizin, 384-388, 2011, DOI: 10.1007/978-3-642-19335-4_79.
     
  • Mang, A., Becker, S., Toma, A., Polzin, T., Schütz, T. A. and Buzug, T. M.: Modellierung tumorinduzierter Gewebedeformation als Optimierungsproblem mit weicher Nebenbedingung, In: Bildverarbeitung für die Medizin, 294-298, 2011, DOI: 10.1007/978-3-642-19335-4_61.
     
  • Schröder, Y., Becker, S., Toma, A., Mang, A., Schütz, T. A. and Buzug, T. M.: Ein diskreter Ansatz zur Modellierung von Tumorwachstum und Strahlentherapie, In: Bildverarbeitung für die Medizin, 379-383, 2011, DOI: 10.1007/978-3-642-19335-4_78.
     
  • Mang, A., Becker, S., Toma, A., Schutz, T. A., Kuchler, J., Tronnier, V., Bonsanto, M. M. and Buzug, T. M.: A model of tumour induced brain deformation as bio-physical prior for non-rigid image registration, In: Biomedical Imaging: From Nano to Macro, 578-581, 2011, DOI: 10.1109/ISBI.2011.5872473.
     
  • Becker, S., Popp, K., Siebert, F. -A., Mang, A., Schuetz, T. A., Toma, A., Buzug, T. M. and Dunst, J.: Computer-basierte Simulation von Tumorprogression und Strahlentherapie bei Hirntumoren, In: Strahlentherapie und Onkologie, 120, 2011.
     
  • Toma, A., Mang, A., Schuetz, T. A., Becker, S. and Buzug, T. M.: An efficient regular lattice approach for discrete modelling of tumour growth, In: Computer Assisted Radiology and Surgery, S360, 2011.
     
  • Toma, A., Mang, A., Schuetz, T. A., Becker, S., Buzug, T. M., Pfenning, P. -N. and Wick, W.: A Nutrient-Guided Chemotaxis-Haptotaxis Approach for Modeling the Invasion of Tumor Cells, In: European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, and Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology, 971, 2011.
     
  • Becker, S., Heye, A., Mang, A., Toma, A., Schuetz, T. A. and Buzug, T. M.: A mathematical model of tumor progression and radiation therapy, In: Computer Assisted Radiology and Surgery, S53, 2011.
     
  • Toma, A., Pfenning, P. N., Mang, A., Schuetz, T. A., Becker, S., Wick, W. and Buzug, T. M.: In-silico-Modellierung der sauerstoffkonzentrationsabhängigen Invasionsgeschwindigkeit von Tumorzellen, In: Proceedings Medizinische Physik, 85-86, 2011.
     
  • Schröder, Y., Toma, A., Becker, S., Mang, A., Schuetz, T. A. and Buzug, T. M.: A Cellular Model of Brain Tumour Growth and the Effects of Radiotherapy, In: Biomedizinische Technik / Biomedical Engineering, 2011, DOI: 10.1515/BMT.2011.860.
     
  • Toma, A., Schuetz, T. A., Mang, A., Becker, S. and Buzug, T. M.: A Novel Hybrid Chemotaxis-Haptotaxis Model to Simulate Glioma Growth, In: Biomedizinische Technik / Biomedical Engineering, 2011, DOI: 10.1515/BMT.2011.836.
     
  • Toma, A., Pfenning, P. N., Mang, A., Schuetz, T. A., Becker, S., Wick, W. and Buzug, T. M.: Concentration Driven Invasion Velocity of Tumor Cells, In: International Conference on Systems Biology, 246, 2011.
     
  • Mang, A., Toma, A., Becker, S., Schuetz, T. A. and Buzug, T. M.: Exploiting Analytical Derivatives for Volume-Constrained Parametric Non-Rigid Image Registration, In: Biomedizinische Technik / Biomedical Engineering, 2011, DOI: 10.1515/BMT.2011.857.
     
  • Becker, S., Mang, A., Schuetz, T. A., Toma, A. and Buzug, T. M.: A mathematical framework for modeling brain tumor progression and responses to radiation therapy, In: Proceedings Medizinische Physik, 35, 2011.
     
  • Toma, A., Mang, A., Schuetz, T. A., Becker, S. and Buzug, T. M.: Is it Necessary to Model the Matrix Degrading Enzymes for Simulating Tumour Growth?, In: Vision, Modeling and Visualization, 361-368, 2011, DOI: 10.2312/PE/VMV/VMV11/361-368.
     
  • Schuetz, T. A., Toma, A., Becker, S., Mang, A. and Buzug, T. M.: Multiscale Modelling of Brain Tumour Growth: The Influence of EGFR on the Molecular and Cellular Level, In: Biomedizinische Technik / Biomedical Engineering, 2011, DOI: 10.1515/BMT.2011.860.
     
  • Becker, S., Mang, A., Schuetz, T. A., Toma, A. and Buzug, T. M.: A mathematical model of brain tumor and normal tissue responses to radiation therapy, In: European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, and Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology, 88, 2011.
     

2010 [ to top ]

  • Becker, S., Mang, A., Toma, A. and Buzug, T. M.: In-Silico Oncology: An Approximate Model of Brain Tumor Mass Effect based on Directly Manipulated Free Form Deformation, Computer Assisted Radiology and Surgery, 5(6), 607-622, 2010, DOI: 10.1007/s11548-010-0531-7.
     
  • Toma, A., Mang, A., Becker, S., Schuetz, T. A. and Buzug, T. M.: A Microscopic Model for Avascular Tumor Growth, In: International Conference on Systems Biology, 201, 2010.
     
  • Toma, A., Mang, A., Becker, S., Schuetz, T. A. and Buzug, T. M.: Ein hybrides Modell zur Beschreibung von avaskulärem Tumorwachstum, In: Deutsche Gesellschaft für Biomedizinische Technik Jahrestagung, BMT.2010.699, 2010.
     
  • Becker, S., Toma, A., Mang, A., Schuetz, T. A. and Buzug, T. M.: Ein kontinuierlicher Ansatz zur nährstoffbasierten Modellierung von Tumorwachstum und Angiogenese, In: Deutsche Gesellschaft für Biomedizinische Technik Jahrestagung, BMT.2010.700, 2010.
     
  • Becker, S., Mang, A., Toma, A. and Buzug, T. M.: Approximating tumor induced brain deformation using directly manipulated free form deformation, In: Biomedical Imaging: From Nano to Macro, 85-88, 2010, DOI: 10.1109/ISBI.2010.5490409.
     
  • Schuetz, T. A., Toma, A., Becker, S., Mang, A. and Buzug, T. M.: Computational Multiscale Modeling of Brain Tumor Growth, In: European Conference on Computational Biology, G21, 2010.
     
  • Mang, A., Toma, A., Becker, S., Schuetz, T. A., Küchler, J., Tronnier, V., Buzug, T. M. and Bonsanto, M. M.: Computer basierte Simulation von Tumorprogression bei Gliomen, In: Jahrestagung der Neuroonkologischen Arbeitsgemeinschaft, 2010.
     
  • Becker, S., Mang, A. and Buzug, T. M.: Approximation des Tumormasseeffekts mittels direkt-manipulierender Free-Form Deformation., In: Bildverarbeitung für die Medizin, 306-310, 2010.
     
  • Mang, A., Becker, S., Toma, A. and Buzug, T. M.: Coupling tumor growth with brain deformation: a constrained parametric non-rigid registration problem, In: SPIE Medical Imaging, 76230C, 2010, DOI: 10.1117/12.844107.
     

2009 [ to top ]

  • Becker, S., Jungmann, J. O., Mang, A. and Buzug, T. M.: Tumor-Wachstumsmodellierung als parametrisches Bildregistrierproblem, In: Bildverarbeitung für die Medizin, 197-201, 2009, DOI: 10.1007/978-3-540-93860-6_40.
     
  • Becker, S., Jungmann, J. O., Mang, A. and Buzug, T. M.: Mass-effect approximation of an isotropic diffusion-based brain-tumor model, In: Computer Assisted Radiology and Surgery, S321, 2009.
     
  • Becker, S., Jungmann, J. O., Mang, A. and Buzug, T. M.: An Adaptive Landmark Scheme for Modeling Brain Deformation in Diffusion-Based Tumor Growth, In: World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, 41-44, 2009, DOI: 10.1007/978-3-642-03882-2_11.
     
  • Becker, S., Mang, A., Jungmann, J. O. and Buzug, T. M.: In-Silico Modellierung von Tumorwachstum: Approximation des Tumormasseeffektes mittels Thin-Plate-Splines, In: 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik, Lecture Notes in Informatics (LNI), 1276-1284, 2009.